Unter einer Organisation versteht man eine konkrete Auswahl und Strukturierung von Ressourcen eines CPS-Pakets durch das Manifest. Die Organisation dient hierbei nur als Behälter für die einzelnen Inhalt-Knoten, welche die Struktur festlegen. Es dürfen durchaus mehr als eine Organisation in einem CPS-Paket vorhanden sein. In diesem Fall sollten sie alle den gleichen Inhalt aber in verschiedenen Ausprägungen vermitteln. So könnte beispielsweise Inhalt in einer Organisation mit traditionellem Text, in einer zweiten durch ein interaktives Spiel und in der dritten mittels eines Hörtexts präsentiert werden.

Die Organisation-Knoten liegen direkt unterhalb des Organisationen-Knotens. Sie dürfen nur dort im Manifest liegen und nicht geschachtelt werden. Organisation-Knoten können in die Zwischenablage ausgeschnitten bzw. kopiert, und aus dieser wieder eingefügt werden. Da sie flach und ohne jede Hierarchie im Manifest liegen, macht ein Verschieben bzw. Kopieren mittes Drag-and-Drop innerhalb des Manifests keinen Sinn, weshalb diese Operationen nicht verfügbar sind.

Für den Fall, dass mehrere Organisation-Knoten exisitieren, kann deren Reihenfolge verändert werden. Dies kann nötig sein, wenn keine Standard-Organisation angegeben ist. Die meisten Anwendungen zum Anzeigen von CPS-Paketen wählen dann nämlich die erste Organisation zur Darstellung.

Sie finden die Organisation-Knoten unterhalb des Organisationen-Knotens in der Manifestansicht im rechten Fensterbereich von jCAPT. Wurde die Organisation bereits mit einem Titel versehen, so wird dieser als ihr angezeigter Name verwendet. Ansonsten wird der symbolische Bezeichner Organisation angezeigt.