In diesem Teil der Bedienungsanleitung wird beschrieben, wie man die Ressourcen für ein CPS-Paket organisiert und auf dem Datenträger physisch strukturiert. Hierbei ist zu beachten, dass jCAPT nicht als Ersatz für einen vollwertigen Dateimanager gedacht ist. Für weitergehende Operationen mit den Ressourcen muss unter Umständen auf einen solchen zurückgegriffen werden. Für die Material-Organisation wird vorausgesetzt, dass ein CPS-Paket geöffnet ist.